El principio rector de los fármacos innovadores quirales estipula claramente que"El método directo para determinar la configuración molecular de fármacos quirales es el análisis de la estructura de rayos X de un solo cristal.". Para fármacos innovadores quirales generales, monocristalinos.difracción de rayos X También se requieren los resultados del análisis de la estructura. Dado que los cristales quirales tienen señales dispersas de forma anómala en los rayos X, el coeficiente de Flack se puede calcular midiendo las señales dispersas de forma anómala y luego se puede obtener la configuración molecular. En comparación con otros métodos analíticos para analizar la quiralidad, la radiografíacristal individualla difracción es más directa y fiable.

Además de la estructura cristalina del fármaco de molécula pequeña, otro uso importante deDifracción de rayos X de monocristales resolver la compleja estructura de las moléculas precursoras de fármacos y las proteínas diana. En los métodos modernos de descubrimiento de fármacos, podemos obtener la estructura de la proteína diana, así como la estructura compleja del fármaco precursor de molécula pequeña y la proteína diana, y ver claramente el modo de acción de los fármacos de molécula pequeña. El diseño de fármacos basado en estructuras, con la ayuda de computadoras, se ha vuelto muy claro y directo. Por lo tanto, la detección de alto rendimiento, la detección virtual, el diseño de fármacos basado en estructuras y la optimización de compuestos principales se han convertido en técnicas comunes para el descubrimiento de fármacos de moléculas pequeñas. Estas tecnologías han tenido mucho éxito y todavía se están enriqueciendo y desarrollando en la actualidad.